病理科

单细胞分析——去除“平均值”干扰

时间:2017-05-01

近日,我科迎来了一个高精密仪器——C1单细胞制备系统。

随着科学的发展,科学家们发觉许多群体细胞,完整个体水平的研究只是研究多种类细胞,多个细胞共同作用的平均值,淹没了细胞个体之间的差异,不利于研究细胞之间的异质性(heterogeneity),因此掩盖了许多生物学研究的真理所在,给生物学研究造成了障碍。因此,针对单个细胞的研究技术,单细胞基因组学研究(Single Cell Genomics Study)成为生物学研究迫切的方向,并成为目前的研究热点。

C1单细胞自动制备系统是基于动态微流控芯片技术,在一块芯片上实现单细胞的核酸样本制备所有步骤。细胞悬液加入到芯片后,系统产生压力,细胞流会沿着流路逐次通过芯片上96个单细胞捕获位点。液流系统会在捕获位点处产生一定的负压,将细胞捕获。捕获后的位点会被细胞封闭,因此一个位点只能捕获一个单细胞;捕获完成后,每个被捕获的细胞都会被送入捕获位点后面一系列纳升级的反应小室中,分阶段完成裂解、反转录、18个循环的预扩增,最后单个细胞制备后的核酸样本,在液流系统作用,单独分配到芯片上独立样本存储孔内。C1单细胞微流控芯片制备系统是一个独立的系统,它制备的单细胞核酸产物可以直接用于单细胞qPCR表达谱和单细胞高通量测序实验。

C1单细胞自动制备系统适用于单细胞mRNA测序样本制备,单细胞全基因组DNA测序样本制备,单细胞的miRNA分析样本制备等;基于单细胞基因表达及测序结果的精确细胞亚群分析;肿瘤单细胞基因组分析,用于肿瘤细胞分化,肿瘤细胞异质化,肿瘤干细胞等方面的研究;胚胎干细胞、造血干细胞、成骨干细胞等干细胞的单细胞基因分析,用于诱导分化机理研究;对神经细胞进行大规模的单细胞基因分析,绘制神经细胞精细分类图谱以及功能研究等等方面。

C1单细胞自动制备系统拥有完整的自动化流程,一步操作实现从单细胞捕获到核酸样本的获取; 通过染色镜检等过程确认单细胞的捕获和活性,更准确地测量单个细胞间的基因表达谱差异;一天内完成从细胞加入到数据收集,每次实验可平行处理96/800个单细胞;以优化的流水线工作流程和直观的界面简化细胞分离和制备过程,避免了人工操作中易污染、误差大的问题。

通过培训,我们对C1单细胞自动制备系统的原理及应用有了深入的了解,C1单细胞自动制备系统的到来也为临床及科研的研究提供了更多的选择!


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